Después de conocer estos datos históricos, accede al recinto sacro donde las tallas de los apóstoles San Pedro y San Andrés, hermanos y apóstoles del Señor, parecen custodiar la entrada. Una extraordinaria bóveda de crucería estrellada sostiene el coro. El medallón de la clave central de mayores dimensiones contiene la imagen de la Virgen con el Niño. En el ángulo izquierdo de la bóveda, un castillo con un león rampante a cada lado representa el escudo de la ciudad de Bayona, diócesis a la que pertenecía la parroquia en la época de su edificación.

Comencemos nuestra visita dirigiéndonos a la nave de la Epístola, situada a la derecha de la entrada principal. Aquí vemos un llamativo Calvario con su habitual composición iconográfica; Jesucristo en la cruz, acompañado de su madre, la Virgen María y el apóstol San Juan. Sobre el conjunto, una colorida vidriera correspondiente al “Bautismo de Jesucristo en aguas del río Jordán”.

En el muro lateral se encuentra el baptisterio y la pila bautismal, cubierta con una original tapa, en la que durante generaciones los hijos de Hondarribia han recibido el bautismo.

A continuación, se encuentran dos retablos de similares características. El primero es el retablo de San Antonio de Padua, uno de los pocos santos al que se le representa con el Niño Jesús en brazos. Las tallas de San Antón y otro santo con sayal están a ambos lados, y en el ático aparece la efigie de San Juan Bautista.

En el retablo contiguo, dedicado a la Virgen del Pilar, está representada la escena de su aparición al Apóstol Santiago en Zaragoza. A ambos lados, dos santos sin determinar, mientras que el conjunto está coronado por el Arcángel San Miguel con el demonio bajo sus pies.

Proseguimos nuestro camino hasta llegar a la cabecera de la nave donde descubrimos el retablo barroco consagrado a Nuestra Señora del Rosario, cuya talla de finos rasgos y gran serenidad ocupa la hornacina central del retablo. María aparece como una joven madre que presenta a su Hijo y adelanta su brazo derecho acercándonos su rosario. La imagen está acompañada por las figuras de San Agustín y otro santo. En el cuerpo superior, entre sobrias columnas, está la figura de Santo Domingo de Guzmán, fundador de los Dominicos, escoltado por las de Santa Catalina de Alejandría y otra santa. El ático es rematado por la imagen del Padre Eterno, y en los extremos fueron colocadas con posterioridad dos figuras alegóricas, la Fortaleza y la Justicia. Son dos de las virtudes cardinales que complementan a las virtudes teologales, la Fe, la Esperanza y la Caridad.

Ahora llegas a los pies del altar donde se encuentra el retablo mayor presidido por Nuestra Señora de la Asunción y del Manzano, a cuya advocación está consagrado el templo. El retablo actual de estilo neogótico fue inaugurado el 8 de septiembre de 1914, festividad de la patrona de la ciudad. Destaca por su esbelta arquitectura y su policromía dorada y está separado del muro para no cubrir los ventanales del ábside que se abre a oriente como es habitual en los templos cristianos.

El anterior retablo fue destruido por un incendio y únicamente se pudieron salvar la delicada talla del Ecce Homo, ubicada en el tabernáculo y las figuras de los apóstoles San Juan y San Andrés, situados en la parte inferior del retablo.

La majestuosa imagen de Nuestra Señora de la Asunción y del Manzano de estilo barroco centra todo el conjunto. Esta obra, originaria de un taller napolitano, llegó a Hondarribia en 1753. La Madre de Dios sostiene en su brazo izquierdo a su hijo, mientras que en su mano derecha sujeta una manzana, símbolo que redunda en la idea de la sabiduría del Hijo de Dios. Flanqueando la imagen de Nuestra Señora podemos ver las correspondientes a San Prudencio y San Francisco de Asís a su izquierda, mientras que a la derecha distinguimos las de Santa Teresa de Jesús y San Ignacio de Loyola, patrono de Gipuzkoa y fundador de los jesuitas.

Proseguimos nuestra visita dirigiéndonos a la nave del Evangelio en cuya cabecera se encuentra el retablo dedicado al Sagrado Corazón de Jesús. Junto a la imagen del Señor, distinguimos la de San Roque que muestra las llagas de su pierna y es acompañado por un perro que le socorría en sus momentos de necesidad, signo de la Providencia, y que siempre aparece incluido en la iconografía del santo. También aparece la efigie saeteada de San Sebastián, mártir con gran devoción en épocas pasadas por ser el patrono de los moribundos y protector contra la peste.

El nicho central del cuerpo superior lo ocupa la imagen de San Pedro revestido como pontífice y sentado en su cátedra, mientras parece bendecir con su diestra. Está escoltado por San Andrés con su característica cruz en aspa y San Pablo.

En la parte inferior de este magnífico retablo, a los pies de la imagen del Sagrado Corazón, parece pasar inadvertido el mayor tesoro que podemos encontrar en este templo, la Presencia Eucarística del Señor en el Sagrario.

Rebasando la puerta de San Jerónimo, la más antigua de la iglesia, y una sobria talla de “Cristo Crucificado” sobre fondo encarnado, podemos observar los retablos de estilo churrigueresco de comienzos del siglo XVIII, de similar factura. El primero de ellos está dedicado a la Virgen Dolorosa cuya imagen ocupa el nicho central. La Madre del Señor aparece doliente ante la Pasión y Muerte de su hijo. A sus pies se encuentra un Cristo Yacente de magnífica talla y con brazos articulados. Ambas imágenes procesionan en la Semana Santa de Hondarribia. Una representación del Espíritu Santo remata el conjunto.

Entre columnas salomónicas, la talla de San José con el Niño Jesús en sus brazos preside el retablo. En la parte superior distinguimos una sugerente figura de la Inmaculada Concepción, mientras que el relieve de Dios Padre ocupa el ático.